紫菜的病烂和环境条件有着密切的关系，受自然条件的左右。如气候的变化可导致一些病害的发生和蔓延。另外，养殖技术及养殖方式的不利，造成环境条件恶化，导致病害的发生与发展。
 
    一、养殖海区环境： 
    ①温度：温度影响紫菜病害的发生有三种情况：一是作为直接的病因，如通潮后干露的紫菜直接受温度的影响；二是作为助长因素，加剧病害的发展，如环境温度刚好适合致病菌的繁殖，而此时藻体本身又抗病能力弱，那么，就会导致紫菜的病烂的发展；三是温度影响环境条件，间接的成为病害的因素，如每年的１１月或１２月，紫菜处于生长旺期，海上又无风浪，海区水温回升，水体交换很差，使二氧化碳及营养盐不能满足藻体生长的需要，造成藻体生理失调，导致紫菜生活力减弱，为病害的发生造成内在因素。 
    ②潮汐差：潮汐差直接影响紫菜的干出时间，干出时间过长或过短不仅影响紫菜发病的生长，而且也是紫菜发病的原因之一。如在低潮区，因干露时间短，所以，在低潮区紫菜白烂病和绿变病的发病比潮位高的海区重。 
    ③降雨量：降雨量直接影响海水的比重，降雨量小，海水比重高；降雨量大，海水比重低，一些致病微生物适合于低盐度下生长繁殖，因此，在降雨量大的季节，紫菜易发生病烂。 
    ④养殖筏架设置的密度：养殖筏架设置的密度，受养殖海区海水流动和交换的限制，而养殖筏架的设置又影响海区海水的流动与交换，海水的流动与交换又会引起紫菜的病烂，三者之间成为相互制约的关系。 

    二、微环境：包括温度、光照强度、光照时间、海水流动速度、风力、盐度、营养盐、ｐＨ值、溶解氧、二氧化碳、共生藻类、附生硅藻及寄生的菌类等。这些微环境受海水流动、潮汐、风浪等自然条件的影响，也受筏架设置的数量、方式、采苗密度和养殖方式的影响。 
对微环境的了解，能够找到紫菜病害的根源，做到从根本上防治。