紫菜丝状体阶段只能在显微镜下才能观察到它们的内部构造，因为它的生长发育阶段不同，所以形态构造上也不同。我们简单划分为五个时期。

（1）果孢子的萌发：果孢子离开藻体后遇有基质，可作短时间的阿米巴虫变形运动，然后附着于基质上呈圆球形，大小与壳孢子相近似，约有9-11微米。在果孢子中央色素体比较集中，但星状态不明显，如条件适宜，果孢子伸出萌发管到基质中共中央总书记贝壳），并延长，即进入丝状体生长阶段。

（2）丝状藻丝的生长：果孢子的萌发管不断伸长，而且不断不规则地分枝，形成了分枝繁密的藻落，肉眼观察仅呈一个点状，许多藻落连成一片，分辨不出原子能来的果孢子。藻丝为细长单列细胞连接而成，细胞直径2-5微米 ，长10几微米到100微米 不等。细胞内亦有沿长轴分布的星状色素体，在光学显微镜下观察，似乎侧生带状，亦有一长椭圆细胞核位于细胞中央。细胞和细胞之间有一像塞子状的孔状联系，这是叶状体细胞所没有的。丝状藻丝的颜色因种类而不同，但同一种类亦光线强弱与光质不同或生长发育阶段不同而有变化。细胞内的在他细胞器也是只能在电子显微镜下才能看到。

（3）壳孢子囊枝形成期（又称膨大藻丝形成期）：营养藻丝长到一定程度，由颇有同感再生出一种形状不同的分枝，细胞直径比营养藻丝粗而短，每枝由数个到数十个细胞组成。细胞内星状色素体明显，中央亦有一个大的蛋白核。到将成熟时细胞之长宽比越来越小，甚至宽大于长。守则孢子整月枝颜色深红、折光性强。壳孢子囊枝的壁厚且呈隆起伏。细胞之间亦有孔状联丝。

（4）壳孢子的形成：壳孢子囊枝发育到一定时候，条件适宜时，细胞开始斜分成横分为2或4个壳孢子，细胞之间的壁融解合成一管状，壳孢子依次从管中放散出来。壳孢子色素体，由星状逐渐集中于中央，成不规则状。

（5）壳孢子的放散：壳孢子形成后，在一定温差下才开始放散。一般从上午7-8点开始，一直到12点或延长到13点（少量），断断续续放散，但约在9：30-11：00期间有一放散高峰，这就是壳孢子的放散日周期性的特点。